Kedvezményezett neve:
Természettudományi Kutatóközpont
A projekt címe: VEKOP-2.3.3-15-2016-00011
Molekulatárak és farmakológiai célfehérjék kölcsönhatásainak vizsgálata
A támogatás összege: 212 000 000 Ft
A támogatás mértéke: 100%
Tartalmi összefoglaló:
A pályázat során kimondottan a kismolekulák és fehérjék kölcsönhatásának detektálására és kvantitatív mérésére fejlesztett nagy-érzékenységű készüléket szereztünk be, ami kiegészült molekulakönyvtár kezeléshez szükséges két további műszerrel (HPLC/MS és liofilizátor készülék). A eszközbeszerzésben tervezett műszereket beüzemeltük, a sikeres tesztüzemek lezajlása után a készülékeket használatba vettük. A létrehozott molekulatár vegyületeit a HPLC/MS készülék segítségével ellenőriztük, kémiai integritás és tisztaság szempontjából vizsgáltuk. A liofilzált formában tárolt vegyületeket feloldás után fehérje-kismolekula kölcsönhatások mérésére használtuk. Meghatároztuk például több kismolekula kötődésének egyensúlyi állandóját ITC illetve SPR segítségével, továbbá vizsgáltuk a kötődés kinetikai aspektusait. A műszerpark segítségével létrejött egy olyan infrastruktúra, melyet például fehérje-kináz inhibitorok fejlesztéséhez használunk (pl kötődési affinitás illetve tartózkodási idő növelésére célzott szerkezet-funkció vizsgálatokban) illetve mérhetjük az intézetben előállított kismolekulák biokémiai hatását fehérjék aktivitására is. Az ITC és SPR készülékek egy további alkalmazása a fehérje-kismolekula komplexekek mellett a fehérje-peptid illetve a fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálata terén valósult meg.
A projekt időtartama:
2017.01.01-2020.12.28.
Koordinátor: dr Reményi Attila
Eszközbeszerzés
LC-MS készülék
SPR-ITC fehérje-kismolekula kölcsönhatás mérőállomás
Komplett liofilizáló rendszer
Publikációk:
Characterization of the Intramolecular Interactions and Regulatory Mechanisms of the Scaffold
Merő B, Koprivanacz K, Cserkaszky A, Radnai L, Vas V, Kudlik G, Gógl G, Sok P,Póti ÁL, Szeder B, Nyitray L, Reményi A, Geiszt M, Buday L. Protein Tks4. Int J Mol Sci. 2021 Jul 28;22(15):8103. doi: 10.3390/ijms22158103.
Peptide Based Inhibitors of Protein Binding to the Mitogen-Activated Protein Kinase Docking Groove.
Alexa A, Ember O, Szabó I, Mo’ath Y, Póti ÁL, Reményi A, Bánóczi Z. Front Mol Biosci. 2021 Jul 1;8:690429. doi: 10.3389/fmolb.2021.690429.
Co-regulation of the transcription controlling ATF2 phosphoswitch by JNK and p38.
Kirsch K, Zeke A, Tőke O, Sok P, Sethi A, Sebő A, Kumar GS, Egri P, Póti ÁL, Gooley P, Peti W, Bento I, Alexa A, Reményi A. Nat Commun. 2020 Nov 13;11(1):5769. doi: 10.1038/s41467-020-19582-3.
High-throughput competitive fluorescence polarization assay reveals functional redundancy in the S100 protein family.
Simon MA, Ecsédi P, Kovács GM, Póti ÁL, Reményi A, Kardos J, Gógl G, Nyitray L. FEBS J. 2020 Jul;287(13):2834-2846. doi: 10.1111/febs.15175.
MAP Kinase-Mediated Activation of RSK1 and MK2 Substrate Kinases.
Sok P, Gógl G, Kumar GS, Alexa A, Singh N, Kirsch K, Sebő A, Drahos L, Gáspári Z, Peti W, Reményi A. Structure. 2020 Oct 6;28(10):1101-1113.e5. doi: 10.1016/j.str.2020.06.007.
Dynamic control of RSK complexes by phosphoswitch-based regulation.
Gógl G, Biri-Kovács B, Póti ÁL, Vadászi H, Szeder B, Bodor A, Schlosser G, Ács A, Turiák L, Buday L, Alexa A, Nyitray L, Reményi A. FEBS J. 2018 Jan;285(1):46-71. doi: 10.1111/febs.14311.
Tracking down protein-protein interactions via a FRET-system using site-specific thiol-labeling.
Söveges B, Imre T, Póti ÁL, Sok P, Kele Z, Alexa A, Kele P, Németh K. Org Biomol Chem. 2018 Aug 15;16(32):5756-5763. doi: 10.1039/c8ob00742j.
A non-catalytic herpesviral protein reconfigures ERK-RSK signaling by targeting kinase docking systems in the host.
Alexa A, Sok P, Gross F, Albert K, Kobori E, Póti ÁL, Gógl G, Bento I, Kuang E, Taylor SS, Zhu F, Ciliberto A, Reményi A. Nat Commun. 2022 Jan 25;13(1):472. doi: 10.1038/s41467-022-28109-x.
Systematic Discovery of FBXW7-Binding Phosphodegrons Highlights Mitogen-Activated Protein Kinases as Important Regulators of Intracellular Protein Levels.
Singh N, Zeke A, Reményi A. Int J Mol Sci. 2022 Mar 19;23(6):3320. doi: 10.3390/ijms23063320.
Incorporation of Oxidized Phenylalanine Derivatives into Insulin Signaling Relevant Proteins May Link Oxidative Stress to Signaling Conditions Underlying Chronic Insulin Resistance.
Mohás-Cseh J, Molnár GA, Pap M, Laczy B, Vas T, Kertész M, Németh K, Hetényi C, Csikós O, Tóth GK, Reményi A, Wittmann I. Biomedicines. 2022 Apr 22;10(5):975. doi: 10.3390/biomedicines10050975
Structural insights into the pSer/pThr dependent regulation of the SHP2 tyrosine phosphatase in insulin and CD28 signaling.
Zeke A, Takács T, Sok P, Németh K, Kirsch K, Egri P, Póti ÁL, Bento I, Tusnády GE, Reményi A. Nat Commun. 2022 Sep 16;13(1):5439. doi: 10.1038/s41467-022-32918-5
Phosphorylation-Assisted Luciferase Complementation Assay Designed to Monitor Kinase Activity and Kinase-Domain-Mediated Protein-Protein Binding.
Póti ÁL, Dénes L, Papp K, Bató C, Bánóczi Z, Reményi A, Alexa A. Int J Mol Sci. 2023 Oct 3;24(19):14854. doi: 10.3390/ijms241914854
Turning Red without Feeling Embarrassed─Xanthenium-Based Photocages for Red-Light-Activated Phototherapeutics.
Egyed A, Németh K, Molnár TÁ, Kállay M, Kele P, Bojtár M. J Am Chem Soc. 2023 Feb 8;145(7):4026-34. doi: 10.1021/jacs.2c11499
Evaluation of bioorthogonally applicable tetrazine-Cy3 probes for fluorogenic labeling schemes.
Albitz E, Németh K, Knorr G, Kele P. Org Biomol Chem. 2023 Sep 20;21(36):7358-7366. doi: 10.1039/d3ob01204b
Bioorthogonally Assisted Phototherapy: Recent Advances and Prospects.
Kozma E, Bojtár M, Kele P. Angew Chem Int Ed Engl. 2023 Aug 14;62(33):e202303198. doi: 10.1002/anie.202303198 Organic Anion Transporting Polypeptide 3A1 (OATP3A1)-
Gated Bio-Orthogonal Labeling of Intracellular Proteins.
Németh K, László Z, Biró A, Szatmári Á, Cserép GB, Várady G, Bakos É, Özvegy-Laczka C, Kele P.
Molecules. 2023 Mar 9;28(6):2521. doi: 10.3390/molecules28062521